드디어 썬더 일레븐 후속 기수가 업로드 되었습니다 수호 & 마루와 함께 축구의 세계로 Go~ Go~!
엡실론을 물리치고 본격적으로 성화와의 만남을 기뻐하는 천둥 축구부. 그 때 나타난 귀정이 그동안 성화가 숨어 있을 수밖에 없었던 이유를 설명해준다. 또한 앞으로는 자유의 몸으로 천둥에 합류할 수 있게 되었다는 사실도... 성화와 함께 다 같이 서울로 돌아온 천둥 축구부는 오랜만에 집으로 가서 재충전의 시간을 갖기로 하지만 그때 하늘에서 검은 공이 날아오고.. 그 공에서 에일리아 학교, 다이아몬드 더스트 팀의 주장 가젤의 목소리가 울려 퍼지는데...
홀리로드 대회가 끝난 후 전국 각지를 돌며 아이들에게 축구를 가르쳐주던 마루는 오랜만에 천둥 중학교로 돌아온다. 그 즉시 축구부를 찾은 마루는 기절초풍할 사태에 직면하게 된다. 얼마 전까지 함께 달리던 축구부원들이 천둥 축구부에 대해 까맣게 잊어버린 것이다. 당황한 마루 앞에 알파라는 소년이 등장하고 마루에게서 축구를 제거해주겠다며 다른 차원인 듯한 곳으로 안내하는데...
세계 축구대회 풋볼 프런티어 인터내셔널 대회를 앞두고 새로운 썬더코리아의 멤버들이 발표되었다! 그러나 기존 멤버 마루와 태검, 동윤을 제외하고는 모두 처음 보는 얼굴들이다. 당황하는 마루와 친구들. 게다가 발표 후 곧바로 시범 경기가 시작되고 상대는 명문 제국 중학교! 당연히 실력파일 줄 알았던 새 멤머들은 마치 축구를 처음 해보는 듯 실수를 연발하고 동윤은 어떻게 저런 멤버들과 싸우냐며 시합을 멈추려 한다. 그러나 마루는 절대 포기할 수 없다며 동윤을 설득하는데...